Yamaha YZF R3 का डिजाइन डायमंड चेसिस के साथ है और यह अपनी पूरानी वर्जिनर्जि बाइक R1 से भिन्न है।
Yamaha YZF R3 में एक डिजिटल इंस्ट्रूमेंट कंसोल शामिल है जिसमें डिजिटल ओडोमीटर, डिजिटल स्पीडोमीटर, डिजिटल फ्यूल गेज, डिजिटल टैकोमीटर और 2 डिजिटल ट्रिपमीटर शामिल हैं।
Yamaha YZF R3 में 321 cc का BS6 ड्यूल-सिलेंडर इंजन है जो 41.4 bhp @ 10750 rpm की मैक्सिमम पॉवर और 29.5 Nm @ 9000 rpm की मैक्सिमम टॉर्क पैदा करता है।
Yamaha YZF R3 बाइक की माइलेज लगभग 35 किलोमीटर प्रति लीटर है और इसमें फ्यूल इंजेक्शन सिस्टम है जो ईंधन दक्षता में मदद करता है।
Yamaha YZF R3 के फ्रंट में USD टेलीस्कोपिक फॉर्क्स और रियर में मोनो-क्रॉस सस्पेंशन है,
Yamaha YZF R3 में ड्यूल चैनल ABS ब्रेकिंग सिस्टम फ्रंट में 298 mm डिस्क और बैक में 220 mm डिस्क के साथ उपलब्ध है। इसमें ट्यूबलेस टायर्स और 17-इंच एलॉय व्हील्स हैं।
Yamaha YZF R3 में सुरक्षा के लिए इसमें डिजिटल फ्यूल गेज, डिजिटल स्पीडोमीटर, गियर इंडिकेटर, लो फ्यूल इंडिकेटर, डिजिटल घड़ी, डे-टाइम रनिंग लाइट्स, और शिफ्ट लाइट जैसी सुरक्षा फीचर्स हैं।
Yamaha YZF R3 में दो कलर ऑप्शन्स है - आइकन ब्लू और यामाहा ब्लैक।